新華社北京1月3日電 英國劍橋大學(xué)領(lǐng)銜的研究團隊日前宣布，他們開發(fā)出一種名為phylowave的分析工具，能追蹤細菌、病毒等病原體“家譜”中種群組成的動態(tài)變化，自動識別危險性較高的新變種，有助于公共衛(wèi)生機構(gòu)及時作出響應(yīng)。
根據(jù)某種病原體不同變種的親緣關(guān)系，可以繪制出它的系統(tǒng)發(fā)生樹。它如同病原體的“家譜”，記錄了不同基因型之間的進化關(guān)系。劍橋大學(xué)等機構(gòu)參與的研究團隊日前在英國《自然》雜志上發(fā)表論文說，他們開發(fā)的新工具能通過來自受感染人群的病原體樣本，追蹤病原體系統(tǒng)發(fā)生樹的動態(tài)變化，根據(jù)“基因距離指數(shù)（表示基因序列差異）”來量化各變種適應(yīng)環(huán)境的能力，輔以多種分析方法，自動識別適應(yīng)性和傳播力較強的新變種。
該工具的有效性在對多種病原體的分析中得到驗證。在對甲型H3N2流感病毒、百日咳桿菌和結(jié)核分枝桿菌等病原體的分析中，新工具不僅識別出已知的各主要變種，還發(fā)現(xiàn)了一些此前未知的、適應(yīng)性較強的變種。
細菌和病毒的進化速度非常快，隨時可能出現(xiàn)傳播力更強、更擅長逃避免疫系統(tǒng)攻擊或能對抗疫苗和藥物作用的新變種。及時識別這些變種并弄清其適應(yīng)性優(yōu)勢何在，是應(yīng)對傳染病挑戰(zhàn)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。
傳統(tǒng)的基因分析方法在鑒定新變種的效率和精度上都有不足之處。此外，根據(jù)基因測序結(jié)果確認新變種往往需要專家團隊討論，具有一定的主觀性。新工具在效率和客觀性上更具優(yōu)勢，對病原體樣本的要求也更低，即使樣本數(shù)量不大、抽樣存在一定偏差，也能有效分析。